Mga produkto

Ang pagtuki sa proteome-wide phosphorylation nga mga panghitabo usa gihapon ka mayor nga analitikal nga hagit tungod sa dako nga pagkakomplikado sa mga network sa phosphorylation sa protina.Sa kini nga trabaho, gisusi namon ang pagkadugtong sa Lys-N, Lys-C, ug trypsin bahin sa ilang abilidad nga makatampo sa global nga pag-analisar sa phosphoproteome.Ang usa ka dalisay nga bersyon sa ubos nga pH nga lig-on nga pagbayloay sa cation gigamit aron epektibo nga magbulag sa N-terminally acetylated, phosphorylated, ug nonmodified peptides.Ang kinatibuk-an nga 5036 nonredundant phosphopeptides mahimong mailhan nga adunay usa ka sayup nga pagkadiskobre nga rate nga <1% gikan sa 1 mg nga protina gamit ang kombinasyon sa tulo nga mga enzyme.Gipadayag sa among datos nga ang pagsapaw sa taliwala sa mga set sa datos sa phosphopeptide nga nahimo nga adunay lainlaing mga protease kay marginal, samtang ang overlap tali sa duha nga parehas nga nahimo nga mga set sa data sa tryptic nakit-an nga labing menos 4 ka beses nga mas taas.Niining paagiha, ang parehas nga paggamit sa Lys-N ug trypsin nakapahimo sa usa ka 72% nga pagtaas sa gidaghanon sa mga nakit-an nga phosphopeptides kung itandi sa d sa trypsin nga nag-inusara, samtang ang usa ka eksperimento nga pagkopya sa trypsin nagdala lamang sa usa ka pagtaas sa 25%.Sa ingon, kung nagpunting lamang sa data sa trypsin ug Lys-N, nahibal-an namon ang 4671 nga dili mabag-o nga phosphopeptides.Ang dugang nga pag-analisar sa mga nakit-an nga mga site nagpakita nga ang Lys-N ug trypsin nga mga data set gipadato sa lainlain nga mga motibo sa phosphorylation, dugang nga ebidensya nga ang mga pamaagi sa multiprotease hinungdanon kaayo sa pag-analisar sa phosphoproteome.