Mga produkto

Ang topology sa lamad sa colicin E1 channel domain gitun-an pinaagi sa fluorescence resonance energy transfer (FRET).Ang FRET naglakip sa usa ka genetically encoded fluorescent amino acid (coumarin) isip donor ug usa ka pinili nga gimarkahan nga cysteine ​​residue nga gitaod sa DABMI (4-(dimethylamino)phenylazophenyl-4'-maleimide) isip FRET acceptor.Ang fluorescent coumarin residue gilakip sa protina pinaagi sa orthogonal tRNA/aminoacyl-tRNA synthetase pares nga nagtugot sa pinili nga paglakip sa bisan unsang site sulod sa colicin channel domain.Ang matag variant adunay mutation sa stop (TAG) para sa coumarin incorporation ug cysteine ​​(TGT) mutation para sa DABMI attachment.Unom ka interhelical nga gilay-on sulod sa mga helice 1-6 ang gitino gamit ang FRET analysis alang sa mga soluble ug membrane-bound states.Ang datos sa FRET nagpakita sa dagkong mga pagbag-o sa interhelical nga mga distansya sa mga helice 3-6 sa asosasyon sa lamad nga naghatag og bag-ong pagsabot sa istruktura nga gigapos sa lamad sa channel domain.Sa kinatibuk-an, ang coumarin-DABMI FRET interhelical efficiencies mikunhod sa pagbugkos sa lamad, nga nagtukod sa payong nga modelo alang sa colicin channel.Usa ka tentative nga modelo alang sa sirado nga kahimtang sa channel domain gimugna base sa kasamtangan ug kaniadto nga gipatik nga FRET data.Gisugyot sa modelo ang lingin nga kahikayan sa mga helice 1-7 sa usa ka sunud-sunod nga direksyon gikan sa extracellular nga kilid ug lamad nga interfacial nga asosasyon sa mga helice 1, 6, 7, ug 10 sa palibot sa sentral nga transmembrane nga hairpin nga naporma sa mga helice 8 ug 9.