Mga produkto

Ang kadaot sa atay nga gipahinabo sa droga mao ang usa sa mga nag-unang hinungdan sa pagkadaot sa droga.Ang katakus sa pagtagna sa mga epekto sa atay sa mga kandidato sa tambal gikan sa ilang mga kemikal nga istruktura hinungdanon aron matabangan ang paggiya sa mga proyekto sa pagdiskobre sa tambal nga eksperimento padulong sa luwas nga mga tambal.Niini nga pagtuon, nag-compile kami og data set sa 951 nga mga compound nga gitaho nga makamugna og halapad nga mga epekto sa atay sa lain-laing mga espisye, nga naglangkob sa mga tawo, rodents, ug nonrodents.Ang mga epekto sa atay alang niini nga set sa datos nakuha isip assertional metadata, nga namugna gikan sa MEDLINE abstracts gamit ang usa ka talagsaon nga kombinasyon sa lexical ug linguistic nga mga pamaagi ug ontological nga mga lagda.Gisusi namon kini nga set sa datos gamit ang naandan nga mga pamaagi sa cheminformatics ug gitubag ang daghang mga pangutana nga may kalabotan sa cross-species concordance sa mga epekto sa atay, mga determinant sa kemikal sa mga epekto sa atay sa mga tawo, ug ang panagna kung ang usa ka gihatag nga compound lagmit nga hinungdan sa epekto sa atay sa mga tawo.Among nakaplagan nga ang concordance sa mga epekto sa atay medyo ubos (ca. 39-44%) tali sa lain-laing mga espisye, nga nagpataas sa posibilidad nga ang espesipiko sa mga espisye mahimong magdepende sa piho nga mga bahin sa kemikal nga istruktura.Ang mga compound gihugpong sa ilang kemikal nga pagkaparehas, ug ang susamang mga compound gisusi alang sa gipaabot nga pagkaparehas sa ilang mga espesye nga nagsalig sa mga profile sa epekto sa atay.Sa kadaghanan nga mga kaso, ang susama nga mga profile naobserbahan alang sa mga miyembro sa parehas nga cluster, apan ang pipila nga mga compound nagpakita nga outlier.Ang mga outlier mao ang hilisgutan sa gipunting nga pagpahayag sa pagbag-o gikan sa MEDLINE ingon man usab sa ubang mga gigikanan sa datos.Sa pipila ka mga kaso, ang mga dugang nga biolohikal nga pagpahayag giila, nga nahiuyon sa mga gilauman base sa kemikal nga pagkaparehas sa mga compound.Ang mga pagpahayag dugang nga nakabig ngadto sa binary nga mga anotasyon sa nagpahiping mga kemikal (ie, epekto sa atay batok sa walay epekto sa atay), ug ang binary quantitative structure-activity relationship (QSAR) nga mga modelo gihimo aron sa pagtag-an kung ang usa ka compound gilauman nga makahimo og mga epekto sa atay sa mga tawo.Bisan pa sa dayag nga heterogeneity sa datos, ang mga modelo nagpakita sa maayo nga predictive nga gahum nga gisusi sa eksternal nga 5-fold nga cross-validation nga mga pamaagi.Ang eksternal nga predictive nga gahum sa binary QSAR nga mga modelo dugang nga gipamatud-an pinaagi sa ilang aplikasyon sa mga compound nga nakuha o gitun-an human ang modelo naugmad.Sa labing maayo sa among kahibalo, kini ang una nga pagtuon alang sa chemical toxicity prediction nga nag-apply sa QSAR modeling ug uban pang mga cheminformatics nga mga teknik sa obserbasyonal nga datos nga namugna pinaagi sa mga paagi sa automated text mining nga adunay limitado nga manual curation, nagbukas sa bag-ong mga oportunidad alang sa pagmugna ug pagmodelo sa kemikal nga toxicology. datos.